真菌培养可确诊，但如从痰液，脓或尿样直接检出有特征性的厚壁无包被酵母菌，直径>8~15μm的宽基芽体也几乎可确诊，用Gomori乌托品银染色，Gridley或PAS染色进行组织病理学检查，可以与新生隐球菌区别，后者比皮炎芽生菌小，基部较窄，有包被形成，,可被Mayer粘蛋白卡红染色或Masson-Fontana黑色素检测法检测，皮炎芽生菌病患者与组织胞浆菌抗原有交叉阳性反应，试验的敏感性不肯定，无其他血清学或皮肤试验 可用于该病诊断。
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