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肿瘤遗传学

时间 : 2009-12-06 00:49:37 来源:www.bookschina.com

[摘要]

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序??前言??第一篇肿瘤遗传学基础??第一章概论第一节肿瘤的生物学特征4??一.癌症是体细胞遗传病4??二.癌细胞的恶性生物学特征5??三.癌的单克隆起源和异质性5??第二节癌变的遗传学途径6??一.概述6??二.癌变途径的获能遗传学事件6??三.癌变途径的失能遗传学事件7??四.癌变遗传学途径的影响或修饰因素8??第三节肿瘤遗传易感性9??一.概述9??二.把关基因和管护基因10??三.强肿瘤易感性基因与家族性癌综合征11??四.弱肿瘤易感性基因及其与环境的相互作用12??第四节肿瘤表遗传学13??一.表遗传学的产生和遗传学的发展14??二.转录的表遗传学调节15??三.肿瘤的表遗传学改变18??四.肿瘤表遗传学研究的应用20??五.存在问题22??第五节应用前景23??参考文献24??第二章人类基因突变的本质27??第一节基因突变的概述27??一.基因突变定义27??二.突变的诱发因素27??三.突变的种类28??四.影响基因突变的因素29??五.基因突变的效应30??第二节基因突变的种类及其机制30??一.单碱基置换30??二.基因缺失37??三.插入41??四.基因重复42??五.倒位43??六.动态突变44??七.线粒体基因组突变44??第三节DNA损伤和修复45??一.DNA损伤的产生45??二.损伤修复49??三.损伤的“耐受性”修复52??第四节基因突变与肿瘤53??第五节基因突变的检测方法55??参考文献60??第三章染色体畸变与肿瘤62??第一节概述63??一.染色体数目畸变63??二.染色体结构畸变和遗传学效应63??第二节白血病.淋巴瘤的染色体易位66??一.概述66??二.急性淋巴细胞白血病(ALL)和非Hodgkin淋巴瘤67??三.急性髓系白血病(AML)70??四.急性混合型白血病(AML):??MLL??融合基因70??五.酪氨酸激酶类癌基因的活化71??第三节实体瘤的染色体异常73??一.神经系统肿瘤73??二.消化系统肿瘤74??三.呼吸系统肿瘤75??四.生殖系统肿瘤75??五.泌尿系统肿瘤76??六.其他恶性肿瘤77??七.良性肿瘤中的??HMGIC??基因的重排78??第四节人类肿瘤的基因扩增79??一.肿瘤细胞的基因扩增现象79??二.基因扩增的机制80??三.基因扩增的生物学意义81??第五节染色体畸变的研究方法和现状81??一.PCR技术在染色体畸变研究中的应用81??二.细胞培养85??三.染色体显带技术及其高分辨技术85??四.体细胞杂交技术86??五.染色体显微切割技术86??六.荧光原位杂交技术87??七.比较基因组杂交88??参考文献88??第四章癌基因90??第一节癌基因的发现90??第二节原癌基因的激活96??一.原病毒插入96??二.基因扩增96??三.染色体重排97??四.点突变101??第三节原癌基因的蛋白质产物102??一.生长因子102??二.生长因子受体103??三.非受体酪氨酸蛋白激酶104??四.细胞质衔接子蛋白105??五.具有GTPase活性的蛋白105??六.GTPase交换因子106??七.胞质丝氨酸苏氨酸蛋白激酶106??八.核内蛋白107??第四节??MYC和MYB??109??第五节??ERBB???┆?111??第六节癌症基因组学112??一.癌基因的协同作用112??二.癌基因与细胞周期112??三.癌基因与细胞凋亡113??四.癌症基因组学的研究实例113??参考文献114??第五章肿瘤抑制基因116??第一节体细胞杂交提供的线索116??第二节从两次击中理论到RB1基因的分离117??第三节几种肿瘤抑制基因及其产物118??一.RB1??二.TP53??三.WT1??四.NF1??五.APC和MCC??六.DCC??七.BRCA1和BRCA2八.TP16和TP15??九.FHIT??十.PTEN??参考文献132??第六章肿瘤转移相关基因135??第一节概述135??第二节肿瘤侵袭转移的细胞学基础136??第三节肿瘤转移的分子基础141??一.癌基因的变异与肿瘤的进展和转移141??二.肿瘤组织中血管生成的分子机制143??三.肿瘤侵袭的分子机制146??四.肿瘤转移中的相关细胞运动因子151??第四节促进和抑制肿瘤转移的其他相关基因152??一.促进肿瘤转移的基因152??二.抑制转移的相关基因155??第五节肿瘤转移相关基因的临床意义161??第六节展望162??参考文献162??第七章人类肿瘤的基因扩增166??第一节概述166??一.基因扩增的生物学意义166??二.基因扩增区的结构167??三.扩增基因在核内的拓扑学168??第二节人类肿瘤扩增的癌相关基因及其机理168??一.人类肿瘤扩增的癌相关基因168??二.癌相关基因的扩增机制170??第三节癌相关基因扩增的临床和生物学意义172??一.原癌基因扩增和乳腺癌二.神经母细胞瘤??MYCN??原癌基因扩增的临床意义179??三.其他肿瘤的基因扩增180??第四节检测基因扩增的常用方法180??一.细胞遗传学技术181??二.荧光原位杂交181??三.Southern分析181??四.半定量PCR182??五.比较基因组杂交182??六.发展趋势183??参考文献184??第八章信号转导与肿瘤188??第一节概述188??第二节跨膜信号转导189??一.蛋白酪氨酸激酶受体突变激活与肿瘤189??二.WNT/β联蛋白信号转导途径与肿瘤190??三.转化生长因子TGFβ/SMAD信号转导途径与肿瘤191??四.细胞黏附与肿瘤信号转导194??第三节细胞内的信号转导途径199??一.MAPK信号转导与肿瘤199??二.PI3K/AKT途径及PTEN201??第四节肿瘤信号转导网络调控203??参考文献205??第九章遗传印记与肿瘤210??第一节正常生物体中的遗传印记现象210??一.生物中的非孟德尔遗传现象210??二.遗传印记的发现211??三.遗传印记的形成与维持215??四.遗传印记的机制216??五.遗传印记的生物学意义218??第二节肿瘤中的异常遗传印记现象218??一.印记相关的遗传性疾病218??二.肿瘤中遗传印记的证据221??三.遗传印记基因致肿瘤发生的途径224??四.印记缺失与肿瘤225??五.LOI在基因表达和肿瘤细胞生长中的作用226??六.肿瘤中LOI的可能机制227??第三节遗传印记基因的检测228??第四节去甲基化与肿瘤治疗229??第五节表遗传学改变和肿瘤229??一.基因.遗传学和表遗传学229??二.癌变的表遗传学事件230??三.表遗传学研究的应用前景234??参考文献235??第十章细胞周期与肿瘤240??第一节历史回顾240??一.生命复制之谜被一层层揭开240??二.肿瘤发生.发展研究与生命复制研究的会合242??三.肿瘤的发生.发展是一个细胞克隆进化的过程243??四.肿瘤是一类细胞周期疾病243??第二节细胞周期机制的核心DDCDK调控机制244??一.细胞周期机制的核心DDCDK调控机制244??二.细胞周期蛋白是调控CDK活性的主要成分245??三.Thr160/Thr161磷酸化249??四.Thr14/Tyr15磷酸化和去磷酸化250??五.细胞周期依赖性蛋白激酶抑制物250??第三节细胞周期机制的两大功能251??一.细胞周期的启动机制251??二.细胞周期的运行机制253??第四节肿瘤的细胞周期机制的破坏255??一.细胞周期监控机制破坏256??二.细胞周期驱动机制破坏257??参考文献258??第十一章细胞凋亡与癌261??第一节细胞凋亡的概念261??一.细胞凋亡概念的提出261??二.细胞凋亡的特征262??第二节与细胞凋亡有关的基因及其产物265??一.BCL2家族266??二.胱冬蛋白酶(caspase)家族270??三.APAF1家族273??四.TNF受体家族275??五.IAP家族280??六.MYC281??七.TP53家族281??第三节细胞凋亡与癌症治疗DD放疗与化疗抗性285??参考文献286??第二篇肿瘤遗传学各论??第十二章家族性癌综合征291??第一节常染色体显性遗传性癌综合征291??一.视网膜母细胞瘤291??二.家族性腺瘤性息肉病292??三.多发性内分泌肿瘤综合征Ⅰ型294??四.多发性内分泌肿瘤综合征Ⅱ型294??五.Wilms瘤296??第二节常染色体隐性遗传性癌综合征297??一.Bloom综合征298??二.着色性干皮病298??三.共济失调毛细血管扩张299??四.Werner综合征300??五.Fanconi贫血300??参考文献301??第十三章大肠癌306??第一节概论306??一.大肠癌的流行学306??二.大肠癌的风险因素和预防因素308??三.大肠癌的分类310??第二节遗传性大肠癌313??一.家族性腺瘤性息肉病314??二.遗传性非息肉型结直肠癌317??三.其他与大肠癌发生有关的遗传综合征323??第三节散发性大肠癌的分子遗传学323??一.肿瘤基因324??二.肿瘤抑制基因324??三.其他遗传变化327??四.大肠癌发生的分子途径和模型329??第四节大肠癌的遗传标志物及其意义330??第五节结论和展望333??参考文献333??第十四章乳腺癌338??第一节概述338??一.流行特点338??二.发病因素338??三.乳腺癌分型340??第二节乳腺癌的遗传流行学与分子流行学341??一.致癌物导致早期生物学效应的标志341??二.致癌敏感性的标志物342??第三节乳腺癌的遗传易感性和发病分子遗传机制344??一.遗传性乳腺癌344??二.散发性乳腺癌346??第四节乳腺癌的遗传学咨询与对策349??一.发病风险的临床评价349??二.对不同人群不同要求的分析350??三.对高危乳腺癌发病风险人群的处理351??第五节乳腺癌相关的细胞分子标志物356??第六节乳腺癌临床研究进展359??一.保乳手术更受重视359??二.乳腺癌前哨淋巴结活检359??三.微转移检测360??四.检测肿瘤生物学标志物指导临床治疗360??五.手术前新辅助化疗的研究360??第七节展望361??参考文献361??第十五章食管癌366??第一节概述366??一.食管癌的流行学366??二.食管癌的分型与分期366??三.癌前病变及早期食管癌的组织学特点367??四.食管癌的病因学367??第二节食管癌的分子细胞遗传学368??第三节食管癌相关基因370??一.细胞周期调节基因370??二.生长因子及其相关基因371??三.黏着分子372??四.凋亡相关基因五.代谢酶基因372??六.最新发现的食管癌相关基因373??七.其他376??参考文献376??第十六章原发性肝癌382??第一节肝癌概述382??一.肝癌的流行学382??二.肝癌的相关病因382??第二节肝癌的遗传流行学384??一.肝癌的家族聚集384??二.肝癌的种族和群体特征385??第三节肝癌的遗传学研究386??一.肝癌的细胞遗传学研究386??二.肝癌的分子遗传学研究387??第四节肝癌的遗传控制393??一.肝癌的遗传监控范围393??二.肝癌的高危人群选择393??三.肝癌遗传预防途径394??参考文献395??第十七章肺癌396??第一节肺癌的临床特征与分型396??第二节肺癌的流行学与病因学396??第三节遗传病例的连锁分析397??第四节散发病例的遗传学改变398??一.细胞遗传学改变398??二.微卫星不稳定性399??三.杂合性丢失400??四.癌基因活性的改变401??五.肿瘤抑制基因活性的改变401??第五节肺癌的遗传易感性402??一.遗传性综合征中肿瘤易感性402??二.脆性部位表达率与肺癌的发生403??三.烟草致癌剂代谢能力的遗传差异与肺癌的发生403??第六节动物模型在确认肺癌遗传学改变上的意义404??第七节遗传学改变对肺癌诊断.治疗与预防的意义404??参考文献405??第十八章胃癌409??第一节胃癌的流行学与病因学409??一.胃癌的流行学409??二.幽门螺杆菌感染及其他生物因素与胃癌发生的关系410??三.胃癌发生的饮食因素411??四.化学因素在胃癌发生中的作用412??第二节胃癌的发生过程及病理学分型413??第三节胃癌癌前病变的遗传学分子改变417??一.胃腺瘤中的遗传学改变417??二.慢性萎缩性胃炎(CAG)中的遗传学改变418??三.从癌前病变到胃癌演进过程中的基因改变419??第四节胃癌发生的分子基础419??一.胃癌中的肿瘤抑制基因改变420??二.胃癌中细胞周期调节分子的改变422??三.胃癌中癌基因及蛋白酪氨酸激酶受体的改变423??四.胃癌中转移相关基因的改变426??第五节胃癌的家族遗传性与易感性427??第六节胃癌的预防.早诊和预后429??一.胃癌的预防429??二.胃癌的预警分子和早期诊断430??三.胃癌的预后430??第七节结束语431??参考文献432??第十九章白血病436??第一节概述436??第二节白血病的分子细胞遗传学机制438??一.转录调控基因的异常调节438??二.酪氨酸激酶引起的癌基因活化453??三.核孔素基因的异常改变455??四.癌基因与肿瘤抑制基因456??第三节展望457??参考文献458??第二十章鼻咽癌465??第一节概述465??第二节鼻咽癌的遗传流行学465??一.鼻咽癌高发家系466??二.鼻咽癌发病率的种族与人群差异467??第三节染色体畸变与鼻咽癌469??第四节鼻咽癌相关基因471??一.细胞原癌基因471??二.肿瘤抑制基因474??三.鼻咽癌相关基因作用机制481??第五节鼻咽癌易感基因482??第六节EB病毒与鼻咽癌484??第七节鼻咽癌的遗传学标志485??第八节小结485??参考文献485??第三篇肿瘤防治??第二十一章肿瘤遗传流行学与遗传咨询493??第一节肿瘤遗传咨询493??一.概述493??二.初次肿瘤遗传咨询495??三.遗传风险的评估和二次咨询497??四.第二次咨询500??第二节家族性癌的遗传学测试与遗传咨询501??一.概述502??二.癌相关基因测试的指征502??三.测试前咨询与知情同意503??四.家族性癌综合征的基因测试503??五.测试后咨询504??第三节家族性癌综合征的管理505??一.家族性癌综合征的遗传学筛查505??二.家族性癌高风险人群的监测506??三.家族性癌的预防507??第四节肿瘤遗传流行学509??一.概述510??二.肿瘤遗传流行学的常用研究方法511??三.肿瘤遗传流行学514??参考文献516??第二十二章肿瘤分子流行学520??第一节概述520??一.分子流行学的研究内容与定义520??二.癌变是一个复杂的多阶段过程521??三.肿瘤基因组流行学的产生523??第二节生物学标志物524??一.暴露生物学标志物524??二.早期生物学效应的生物学标志物526??第三节鉴定人癌的病因因子527??一.致癌剂的体内浓度528??二.致癌剂DNA加合物的特征528??三.检测暴露人群的早期生物学效应529??四.在易感亚群中评价病因因子530??第四节个体癌易感性的影响因素530??一.遗传因素532??二.种族532??三.年龄.性别和健康状况534??四.饮食与营养535??第五节癌的预防和风险评价536??一.大部分肿瘤可以预防537??二.提供早期警报537??三.重点保护癌易感人群537??四.早期诊断与治疗538??第六节存在的问题与展望538??一.存在问题538??二.前景539??参考文献539??第二十三章肿瘤的遗传易感性543??第一节高度外显的种系突变与肿瘤易感性543??一.肿瘤抑制基因种系突变543??二.DNA修复基因种系突变545??三.癌基因种系突变546??第二节基因多态与肿瘤易感性547??一.基因[CD*2]环境交互作用与皮肤癌547??二.代谢基因多态性与肿瘤易感性548??三.DNA修复基因多态性与癌症易感性560??四.细胞生长控制基因多态性与癌症易感性565??第三节癌症遗传易感性种族差异与基因多态568??参考文献569??第二十四章致癌致突变剂的遗传毒理学576??第一节概述576??一.遗传毒理学的产生和发展576??二.遗传毒理学的研究内容及其意义576??三.遗传学损伤的类型577??第二节化学致癌579??一.概述579??二.人类的化学致癌物质581??三.致癌物质的体内代谢582??四.肿瘤促进因子583??第三节遗传毒理学短期测试583??一.概述583??二.常用的遗传毒理学短期测试法585??三.试验策略和设计590??第四节化学品对人类遗传和潜在致癌风险的评价592??一.遗传风险的评价592??二.致癌风险的预测595??三.阈值问题596??第五节人群的生物学监测596??一.人群监测的生物学标志物596??二.生殖细胞的致突变效应597??三.体细胞的致突变效应598??第六节存在问题与展望599??参考文献600??第二十五章肿瘤的耐药性603??第一节多药耐药基因和P糖蛋白604??一.多药耐药基因604??二.P糖蛋白605??三.P糖蛋白介导MDR的机制606??四.P糖蛋白介导MDR的逆转607??第二节多药耐药相关蛋白607??一.MRP家族607??二.MRP与多药耐药609??三.MRP的抑制剂610??第三节肺耐药蛋白610??一.肺耐药蛋白的特性610??二.LRP介导耐药的机制611??三.??LRP??表达的临床意义611??四.LRP与MRP和P糖蛋白的关系612??五.LRP介导多药耐药的逆转613??第四节乳腺癌耐药蛋白613??一.乳腺癌耐药蛋白的特性613??二.BCRP介导耐药的机制614??三.BCRP介导耐药的逆转策略614??四.展望615??第五节蛋白激酶C与肿瘤多药耐药615??一.蛋白激酶C的生物学特性615??二.PKC与肿瘤化疗耐药616??第六节金属硫蛋白617??一.金属硫蛋白的分子特性617??二.MT引起肿瘤耐药的机制618??三.MT与肿瘤的发生618??四.MT高表达的临床意义619??第七节与耐药619??一.基因的发现与表达619??二.的生物学功能及其作用机制620??三.与肿瘤化疗耐药〖JY.〗620??第八节基因芯片技术在肿瘤耐药研究中的应用621??一.基因芯片在肿瘤耐药研究中的作用621??二.基因芯片技术在肿瘤耐药研究中的进展621??三.展望623??参考文献624??第二十六章肿瘤的生物治疗630??第一节肿瘤生物治疗的基本概念.治疗原理及其种类630??第二节各种生物疗法对肿瘤的治疗作用及其在肿瘤治疗中的应用631??一.卡介苗等微生物制剂631??二.抗体的导向治疗633??三.细胞因子输注疗法637??四.过继免疫治疗641??五.特异性主动免疫治疗643??六.基因治疗646??第三节对生物治疗在恶性肿瘤治疗中作用的评价660??参考文献660??第四篇肿瘤遗传学的研究方法??第二十七章常用核酸分析技术667??第一节PCR技术667??一.PCR的基本原理和常规操作667??二.一些衍生PCR技术669??三.PCR技术在临床上应用672??第二节核酸分子杂交673??一.探针的制备和标记674??二.DNA杂交675??三.RNA印迹杂交和菌落原位杂交677??四.比较基因组杂交678??第三节核酸序列测定679??一.化学降解法679??二.Sanger酶法的基本原理679??第四节基因表达系统分析法681??一.基本原理682??二.技术流程682??三.主要试剂和材料684??四.实验方法684??五.SAGE的应用688??参考文献689??第二十八章生物芯片691??第一节生物芯片发展简史691??第二节生物芯片的基本原理和主要技术692??一.原理:分子识别与杂交的规律692??二.关键技术694??第三节主要技术装置和实验方法697??一.微点阵系统697??二.杂交室(盒)699??三.芯片微阵扫描器699??第四节生物芯片的应用701??一.DNA测序和突变的研究701??二.基因制图和基因型分型研究703??三.RNA(基因)表达的研究705??四.比较基因组的研究708??五.环境基因组计划研究709??六.群体遗传学和人类进化的研究710??七.对疾病研究的意义713??八.新药发明和开发的研究715??第五节生物芯片DNA微阵的局限性和存在的问题717??第六节生物芯片技术的重大意义718??参考文献719??第二十九章荧光原位杂交技术721??第一节概述721??第二节荧光原位杂交探针722??一.探针分类722??二.探针标记方法724??第三节荧光原位杂交程序725??一.组织细胞制片725??二.杂交前预处理726??三.原位杂交727??四.杂交后洗涤728??五.杂交信号的检测728??六.玻片复染728??七.镜检与结果分析728??八.杂交玻片保存729??第四节荧光原位杂交与染色体显带729??第五节荧光原位杂交技术分类及其应用729??一.染色体片杂交730??二.间期细胞杂交730??三.比较基因组杂交731??第六节荧光原位杂交与流式细胞术及DNA图像分析731??附录一常用荧光原位杂交程序732??一.探针的标记732??二.杂交混合物的配制733??附录二荧光原位杂交分析常见问题及可能的解决途径737??参考文献737??第三十章比较基因组杂交739??第一节比较基因组杂交的原理740??第二节比较基因组杂交程序740??一.DNA探针的制备740??二.DNA探针的标记743??三.细胞标本的制备746??四.探针和样品的变性749??五.原位杂交751??六.荧光探针检测751??第三节结果分析753??第四节比较基因组杂交技术的应用754??第五节比较基因组杂交技术的评价755??一.CGH的优点755??二.CGH的不足755??三.与其他方法比较756??四.CGH成像分析的改进757??第六节展望758??参考文献758??第三十一章染色体分析技术761??第一节染色体标本的制备761??一.理论依据761??二.细胞培养762??三.分裂相的捕获762??四.低渗处理763??五.固定763??六.制片763??第二节染色体显带764??一.G显带764??二.R显带764??三.Q显带765??四.C显带765??五.高分辨显带765??第三节染色体的识别766??一.染色体的分组766??二.染色体ISCN特征767??三.染色体畸变769??附录染色体标本制备和显带的操作程序772??一.染色体标本的制备772??二.细胞同步化和高分辨染色体制备773??三.染色体显带774??参考文献775??第三十二章微核试验777??第一节概述777??一.微核研究简史777??二.微核形成的细胞动力学778??第二节哺乳动物骨髓细胞微核试验783??一.基本原理783??二.实验准备783??三.实验程序783??四.阅片与结果评价785??第三节微量外周血人体内淋巴细胞微核测试法785??一.基本原理785??二.实验准备785??三.实验程序786??四.阅片与结果评价787??第四节培养人淋巴细胞的胞质分裂阻滞微核试验788??一.基本原理788??二.实验准备788??三.实验程序789??四.阅片与结果评价790??第五节脱落细胞微核试验790??一.脱落细胞微核试验的常规技术790??二.脱落细胞微核试验的荧光原位杂交技术793??三.脱落细胞微核试验应用的述评794??第六节微核的流式细胞仪自动化检测794??一.红细胞微核的流式仪自动化检测795??二.有核细胞微核的流式仪自动化检测796??第七节微核试验的评价和展望799??参考文献??第三十三章基因工程小鼠803??第一节概念803??一.基因工程小鼠的分类803??二.基因工程小鼠的应用805??第二节转基因小鼠的产生807??一.历史背景807??二.产生的过程808??三.几个特殊问题817??第三节基因剔除小鼠的产生819??一.历史背景819??二.组成型基因剔除小鼠的产生过程821??三.诱导型基因剔除小鼠的产生过程829??四.几个问题831??第四节基因替换小鼠的产生832??第五节基因工程小鼠在肿瘤研究中的应用832??一.基因工程小鼠在肿瘤研究中的优势832??二.基因工程小鼠在肿瘤研究中的作用833??三.基因工程小鼠肿瘤模型的发展趋势836??参考文献836??第三十四章生物信息学在肿瘤研究中的应用841??第一节与肿瘤研究相关的基本数据库841??第二节肿瘤相关基因的电脑克隆844??第三节肿瘤相关的单核苷酸多态性SNP846??第四节肿瘤组织的基因功能表达谱849??第五节肿瘤相关蛋白的空间结构模拟和药物设计851??第六节与肿瘤研究相关的几个重要网站852??参考文献或网站
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